明朝万历年间，朝廷内忧外患，古龙镇一所名为飞刀门的武馆因战乱而日渐萧条。老李飞刀师傅和他的两个关门弟子万里风、牛大春一起过着与世无争的平静生活。好景不长。老李飞刀的结拜兄弟、起义军首领郭敬明将女儿郭莹莹托付给老李飞刀照顾。与此同时，老李飞刀儿时的妹妹牛万军被皇帝选为贵妃。还有，由于后宫争斗，她带着女儿仙蒂和太监小到飞刀门避难。这些人生活在同一个屋檐下，却立场相反。老李飞刀努力化解双方的隔阂，同时保护师妹免受皇后爪牙的攻击。在经历了老李飞刀对自己的所作所为后，牛贵妃和曾经的哥哥重归于好。郭敬明和朝廷的夏将军都曾来华山参加二十年的剑论，意图拉拢武林人士到华山为剑论服务。然而途中传来日军入侵的消息，起义军与朝廷官兵和好如初，共同抵御外敌。老李飞刀组织武林人士辅佐官军为首领，朝廷表彰其功绩。飞刀门被授予“武学第一门”的称号。